Ralf Schumacher im Regen in Suzuka schnellster.

Regen im Land der aufgehenden Sonne behinderten die Piloten mal mehr, mal weniger. Nach dem Regentraining am Morgen trocknete die Strecke etwas ab, bis Michael Schumacher auf die Strecke kam und im Regen absoff. Am Ende konnte sich Ralf Schumacher mit einer nicht fehlerfreien Runde und einer Zeit von 1:46,106 im Toyota die Poleposition sichern. Zweiter wurde Jenson Button (BAR-Honda) und komplettierte die Japanische erste Startreihe. Dritter Platz ging an Giancarlo Fisichella (Renault), der auf der Strecke war, als es anfing zu regnen. Vierter wurde der Österreicher Christian Klien (Red Bull) vor dem Lokalmatador Takuma Sato (BAR-Honda), David Coulthard (Red Bull), Mark Webber (BMW-Williams) und Jacques Villeneuve (Sauber), der jedoch in seiner Runde langsamer machen musste, da Jarno Trulli, der zuvor abgeflogen war, geborgen wurde. Rubens Barrichello (Ferrari) wurde neunter vor seinem Landsmann und Ferrari Nachfolger Felipe Massa (Sauber). Narain Karthikeyan erreiche im Jordan-Toyota Startplatz elf vor Antonio Pizzonia (BMW-Williams), der auch in den letzten beiden Rennen Nick Heidfeld vertreten wird. Pizzonia drehte sich schon in seiner Inlap von der Strecke. Christijan Albers erreichte im Minardi den dreizehnten Startplatz vor Michael Schumacher (Ferrari) und Robert Doornbos (Minardi). Der neue Weltmeister, Fernando Alonso schwamm im Renault auf den sechzehnten Platz vor Kimi Räikkönen (McLaren Mercedes), der jedoch wegen eines Motorwechsels sowieso zehn Plätze nach hinten gemusst hätte. Juan Pablo Montoya im zweiten McLaren brach sein Qualifying ab und fuhr in die Box. Wie zuvor schon erwähnt, drehte sich Jarno Trulli, mit Bestzeit unterwegs, von der Strecke. Auch Tiago Monteiro (Jordan-Toyota) rutschte von der Strecke und konnte noch nicht mal seine schnelle Runde beginnen.